鸡球虫病常用治疗药物有氯吡醇、磺胺喹啉、莫能霉素、氯苯胍、球痢灵、青霉素等，请按照使用说明进行防治。建议交替使用或联合使用，疗程要足，尽量一次治愈，以免产生耐药性，给再次治疗造成更大的麻烦。药物治疗的同时，鸡舍要及时消毒和清粪。虫卵在潮湿的粪便中可长时间生存，并且消毒药对它作用甚微。所以必须每日清粪，清干净后用火碱水冲刷粪板，然后再用生石灰铺垫。