主要是表达意思上的区别：
无根之水是古代服药时常用的一种药引或制药时用的材料。用于服药时送药物咽下，或调制解痈肿毒的敷药等。是中国古代与童子尿齐名的著名药引。
无垠之水，释义：从天上降下来的雨水，不沾惹因果，有驱邪的作用。
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无根水是古代服药时常用的一种药引或制药时用的材料， 也是取水方法的一种，因时，因地，因具体条件便宜从事。有些茶人取初雪之水、朝露之水、清风细雨中的“无根水”。从某个角度看这些未沾地雨水、井水、河中的流水含有的病菌少，对治疗效果确实有帮助。